客戶案例一 華東某醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所的FFPE樣本處理困境

①客戶背景：

這是一家第三方醫(yī)學(xué)?？茩z驗(yàn)機(jī)構(gòu), 它專門致力于腫瘤基因檢測(cè), 實(shí)驗(yàn)室規(guī)模處于中等水平階段, 日常主要從事大量臨床中FFPE（石蠟包埋手法處理后的）組織樣本的處理工作。它的核心業(yè)務(wù)是與NGS（二代測(cè)序技術(shù)）協(xié)同合作開展針對(duì)腫瘤情形的靶向用藥基因檢測(cè)項(xiàng)目, 在此過程中面臨如下挑戰(zhàn), 即樣本來源情況復(fù)雜多樣, DNA質(zhì)量高低不一、優(yōu)劣不齊。

②客戶痛點(diǎn)：

實(shí)驗(yàn)室先前的打斷設(shè)備, 說的是傳統(tǒng)的探頭式超聲儀, 在面對(duì)FFPE樣本之際, 常常會(huì)出現(xiàn)樣本之間交叉污染的狀況。鑒于探頭必定需要直接去接觸樣本, 每一次更換樣本時(shí), 都得嚴(yán)格對(duì)探頭進(jìn)行清洗才行, 非但效率很低, 而且還曾經(jīng)好些次致使關(guān)鍵樣本受到污染, 進(jìn)而影響到檢測(cè)報(bào)告的出具。此外, 傳統(tǒng)設(shè)備在處理微量樣本之時(shí), 片段化長(zhǎng)度并不夠集中, 從而導(dǎo)致后續(xù)文庫構(gòu)建失敗率偏高。

③解決方案：

在經(jīng)過技術(shù)評(píng)估之后, 萊恩德做出了推薦, 其所推薦的是 LD-D100 非接觸式超聲波 DNA 打斷儀。該設(shè)備運(yùn)用的是全封閉試管處理方式, 每個(gè)樣本都是在獨(dú)立管中進(jìn)行打斷操作, 從物理層面上杜絕了交叉污染情況的發(fā)生。與此同時(shí), LD-D100 具備 23KHz 頻率自適應(yīng)功能, 此功能能夠依據(jù)樣本液體的粘稠度自動(dòng)進(jìn)行調(diào)整, 從而確保片段化效果的均一性。實(shí)驗(yàn)室另外配備了低溫水浴外接接口, 這切實(shí)預(yù)防了FFPE樣本于超聲期間, 因局部熱量過度致使DNA發(fā)生變性的情況。

④應(yīng)用效果：

引入萊恩德LD-D100之后, 實(shí)驗(yàn)室的文庫構(gòu)建成功率提高了大概15%, 由于打斷不均致使的重復(fù)實(shí)驗(yàn)顯著減少。封閉式處理方案使得技術(shù)人員從繁雜的探頭清洗工作里解脫出來, 單批次處理通量增加了一倍, 人力成本也獲得了有效控制。

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客戶案例二 北方某高校基因功能研究組的碎片化難題

①客戶背景：

此研究組歸屬于一所核心院校, 長(zhǎng)久地致力于植物基因功能以及表觀遺傳學(xué)從事研究。實(shí)驗(yàn)室配置了完備的分子生物學(xué)平臺(tái), 學(xué)生跟科研人員平常之時(shí)要開展諸如ChIP-seq（染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序）以及ATAC-seq（轉(zhuǎn)座酶可及性染色質(zhì)測(cè)序）這類實(shí)驗(yàn), 對(duì)于DNA片段化處理的精確程度以及溫度控制存在很高要求。

②客戶痛點(diǎn)：

研究組先前嘗試過并非品牌的超聲設(shè)備, 然而卻發(fā)覺參數(shù)設(shè)定不太足夠靈活, 沒有辦法針對(duì)特定類別的染色質(zhì)樣本展開準(zhǔn)確片段化。特別是在進(jìn)行ChIP實(shí)驗(yàn)之際, 超聲致使的溫度升高會(huì)讓染色質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變, 這會(huì)直接對(duì)后續(xù)抗體富集效率產(chǎn)生影響, 實(shí)驗(yàn)重復(fù)性一直以來都不太理想。另外, 設(shè)備操作界面很復(fù)雜, 新入學(xué)的碩博生需要?dú)v時(shí)較長(zhǎng)才能夠?qū)W得明白使用方法。

③解決方案：

萊恩德技術(shù)團(tuán)隊(duì)鑒于其表觀遺傳實(shí)驗(yàn)的特性, 推舉了 LD-D200 混頻超聲 DNA 打斷儀, 該儀器擁有 15 - 100KHz 的寬頻混頻功能, 可依不同染色質(zhì)模板的物理特性, 生成更具成效的空化效應(yīng), 其配備的 7 英寸醫(yī)療級(jí)觸摸屏, 界面直觀, 諸如超聲波功率、間歇時(shí)間、總工作時(shí)長(zhǎng)等參數(shù), 均可依據(jù)實(shí)驗(yàn)需求徑直設(shè)定。還特別啟用了用戶密碼保護(hù)功能, 針對(duì)不同課題組的成員, 設(shè)置了獨(dú)立的操作權(quán)限, 如此一來, 避免了參數(shù)被誤改。

④應(yīng)用效果：

在 LD - D200 投入使用之后, 研究組于 ChIP - seq 實(shí)驗(yàn)里所獲取的 DNA 片段峰圖, 變得越發(fā)銳利起來, 并且其分布狀況相較于從前, 更加契合測(cè)序平臺(tái)所提出的要求。與此同時(shí), ATAC - seq 實(shí)驗(yàn)中得到的 DNA 片段峰圖同樣如此, 峰圖變得更為銳利, 分布也更符合測(cè)序平臺(tái)要求了。而且, 該實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)穩(wěn)定性有了顯著的提升, 不同批次之間所呈現(xiàn)出的結(jié)果一致性, 使得課題組成員對(duì)于數(shù)據(jù)的信心大幅增強(qiáng)。另外, 外置冷水機(jī)接口的存在, 為整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程的溫控精度提供了保障, 進(jìn)而有效地降低了實(shí)驗(yàn)過程中變量所產(chǎn)生的干擾。

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客戶案例三 南方某法醫(yī)鑒定中心的微量證據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化處理

①客戶背景：

該法醫(yī)鑒定中心承擔(dān)著區(qū)域內(nèi)很大數(shù)量的民事訴訟以及刑事犯罪案件的DNA鑒定工作, 在此工作中, 實(shí)驗(yàn)室對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)化的操作以及證據(jù)鏈的完整性有著非常高的要求。它所涉及的樣本類型包含了像是血跡、精斑、微量接觸DNA等, 而這些樣本在量上常常僅僅只有納克甚至是皮克這樣的級(jí)別, 極為珍貴。

②客戶痛點(diǎn)：

此前處理方式因樣本極其微量, 難以實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化, 同一臺(tái)設(shè)備由不同技術(shù)人員操作, 片段化結(jié)果存在很大差異。中心急需一款處理精度高且操作流程可追溯的設(shè)備, 用以確保鑒定結(jié)果的客觀性與法律效力。同時(shí), 設(shè)備要具備極強(qiáng)穩(wěn)定性, 不能因機(jī)器故障致使珍貴樣本報(bào)廢。

③解決方案：

萊恩德給其供應(yīng)了 LD-D300 高頻混頻超聲波打斷儀, 該儀器支持20 - 400KHz三檔頻率可調(diào)節(jié)（低/中/高頻）, 對(duì)于法醫(yī)樣本里常見的微量、降解 DNA, 能夠憑借選擇特定頻段達(dá)成高效且溫和的打斷, 大程度防止樣本損失，而且設(shè)備內(nèi)置的故障自動(dòng)報(bào)警以及超溫保護(hù)功能, 給關(guān)鍵樣本增添了一道安全保險(xiǎn)。此外, LD - D300的支架旋轉(zhuǎn)電機(jī), 是運(yùn)用電池來驅(qū)動(dòng)的, 并不需要外接電源線, 這就讓實(shí)驗(yàn)室的工位布局, 更為簡(jiǎn)潔, 更為安全。

④應(yīng)用效果：

在運(yùn)用萊恩德LD - D300之后, 該中心成功構(gòu)建起了磁珠提取之后的DNA標(biāo)準(zhǔn)化片段化流程。設(shè)備操作具備高度的一致性, 這致使不同的鑒定人員在處理同類樣本之際, 片段化結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn)差削減了超過30%。從設(shè)備開始運(yùn)行直到現(xiàn)在, 未曾出現(xiàn)過因?yàn)樵O(shè)備問題所引發(fā) 的樣本中斷事件, 其穩(wěn)定性以及可靠性獲得了鑒定人員的一致認(rèn)同。

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客戶滿意度數(shù)據(jù)

（備注：以上數(shù)據(jù)基于萊恩德對(duì)近百家科研及醫(yī)療機(jī)構(gòu)用戶的匿名滿意度調(diào)研統(tǒng)計(jì)得出。）

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總結(jié)

通量與防污染方面, 基因檢測(cè)中心提出了高要求, 精確性與重復(fù)性上, 高校課題組有著出色追求, 標(biāo)準(zhǔn)化與穩(wěn)定性乃是法醫(yī)鑒定的剛需, 萊恩德超聲波DNA打斷儀借助非接觸式設(shè)計(jì)、靈活的混頻配置、準(zhǔn)確的溫控方案以及穩(wěn)定的系統(tǒng)性能, 于不同應(yīng)用場(chǎng)景里都呈現(xiàn)出了產(chǎn)品對(duì)復(fù)雜需求的適配能力。技術(shù)團(tuán)隊(duì)可針對(duì)具體痛點(diǎn)給予定制化解決方案以及及時(shí)的技術(shù)支撐, 于此來看, 萊恩德產(chǎn)品得到科研工作者持續(xù)信賴就在于此項(xiàng)緣由。要是您正尋覓一款更能領(lǐng)會(huì)實(shí)驗(yàn)需求之DNA打斷儀, 那么能夠經(jīng)由萊恩德官方渠道去獲取產(chǎn)品選型以及技術(shù)方案支持。

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